特殊胎牛血清分类：胚胎干细胞血清，热灭活血清，活性炭处理血清，透析处理血清，gamma照射血清，低IgG含量，干细胞血清等。
胚胎干细胞血清
与其它类型血清相比，胚胎期动物血清含有更多的生长因子，及较少的gamma球蛋白含量。
热灭活血清
胎牛血清的常规处理方式是热钝化，即放在56°水浴30分钟；其目的是使血清中的补体成分及一些未知的细胞生长抑制分子失活。
与胎牛血清的其它加工方式一样，热钝化处理过程必须小心谨慎，因为血清中的生长因子容易在较高温度或者较长时间加热条件下失活，甚至产生沉淀。
GIBCO品牌的热灭活胎牛血清用在细胞培养中，来研究UCP-2及UCP-3，核因子kappa-B，蚕杆状病毒表达系统中表达FMDV衣壳蛋白，亚临床的移植物抗宿主病 ，IFN-gamma的作用，及自噬。HyClone公司的热灭活胎牛血清用来研究能引起严重急性呼吸综合征的冠状病毒的核衣壳蛋白，NO，激活素C，及IE1。Sigma公司的热灭活胎牛血清用来研究化疗，而Equitech-Bio公司的热钝化胎牛血清用来研究谷胱甘肽巯基转移酶Pi 。
活性炭处理血清
活性炭能够结合脂溶性分子，因此能够用来除去激素类物质，例如，胎牛血清中的雌二醇、孕酮、皮质醇、睾酮及T3和T4分子。血清中这些脂类激素能够干扰免疫检测及胰岛素检测方法。
HyClone公司的活性炭吸附的胎牛血清（csFCS）被用来识别TGF-beta家族成员 。
透析处理血清
透析处理能够除去胎牛血清中所有分子量小于10,000Da的分子。例如，激素、细胞因子、葡萄糖、氨基酸还有许多其它分子，都能够被除去。透析也能除去胎牛血清中的抗生素及其它内源分子。
GIBCO的透析处理的胎牛血清被用来研究驱动蛋白5B 及丙酮酸激酶M2失活 ， HyClone的透析处理胎牛血清用来研究KRAS信号通路的突变，而Sigma公司的透析处理胎牛血清用来研究PAH代谢情况 。
gamma照射血清
Gamma照射能够对胎牛血清进行灭菌处理。胎牛血清常规的灭菌方法是多次透过0.1um的滤膜以消除微生物污染，而gamma照射能够钝化牛群中常见的病毒。但是，一些类型的病毒能够抵抗gamma照射，比如细小病毒。
低IgG含量
低IgG的胎牛血清适用于抗体生产及相关领域。
干细胞培养血清
与一般细胞培养相比，干细胞培养对生长因子有更严格的要求。由于胎牛血清中的一些生长因子促进干细胞分化，所以，需要检测各批胎牛血清在保持不同类型干细胞的性方面的性能。
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